Créée pour recueillir, conserver et promouvoir les documents utiles à la rédaction de l'histoire du mouvement ouvrier, l'AEHMO a constitué un ensemble d'archives accessible aux chercheurs. Il est déposé au Cabinet des manuscrits de la Bibliothèque cantonale et universitaire (BCU) de Lausanne-Dorigny et confié aux bons soins de la Conservatrice, Danielle Mincio . Il représente aujourd'hui l'un des plus importants fonds ouvriers en Suisse romande. Il conserve les archives de l'Association, telles que définies dans la convention signée en 1986 par la BCU et l'AEHMO, ainsi que des fonds appartenant à différents dépositaires et faisant l'objet de conventions particulières. L'ensemble équivaut actuellement à 180 mètres linéaires des dépôts du Cabinet des manuscrits de la BCU, avec l'espoir que chaque année il s'enrichira de nouveaux prêts ou dons.
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